سمي الختان الفرعوني بهذا الاسم نسبة الي فرعون موسي( عليه السلام ) ، عندما أراد ان يحد من إنجاب الذكور ، خوفاً من نبوءة قتله علي يد أحد أبناء بني إسرائيل ، فأرد ان يمنع النساء من الإنجاب، فقام بأمر عمل ختان او تشويه للأعضاء التناسلية ، مما يجعل النساء غير قادرين علي الولاده بدون مساعدة القابلات .